Запрет на Active Desktop
Active Desktop позволяет вставлять в оформление рабочего стола HTML-файлы, ссылки из Интернета, файлы с картинками и анимацией и т.п. в качестве обоев. Чтобы исключить эту особенность, которая отнимает ресурсы у компьютера, присвойте параметру типа DWORD NoActiveDesktop значение 1 в разделе

HKCU\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Policies\Explorer

При этом

удаляется пункт Active Desktop из контекстного меню, вызываемого правой кнопкой мыши на Рабочем столе

удаляется вкладка Web из апплета Экран в Панели управления

становится недоступным пункт Отображать веб-содержимое на рабочем столе на вкладке Общие апплета Свойства папки в Панели управления

Время, отведенное на мигание
Когда программа требует ввода данных, она может либо выскочить на передний план, либо начать мигать кнопкой на панели задач. Вы можете установить время,в течении которого программа будет сигнализиоровать перед этим выходом. Для этого нужно в разделе

HKCU\Control Panel\Desktop
создать или изменить параметр ForegroundLockTimeout типа DWORD и установить его значение на время задержки до "перехвата" фокуса в миллисекундах: 0 — окно сразу выскакивает вперед, 200 000 — значение по умолчанию.

Существует возможность скрытия всех элементов на Рабочем столе. Будут доступны только панель задач и меню кнопки Пуск. Для этого создайте ключ типа DWORD NoDesktop со значением 1 в разделе

HKCU\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Policies\Explorer

Существует возможность вывода номера версии и номер сборки Windows в нижнем правом углу Рабочего стола. Для этого создайте ключ типа DWORD PaintDesktopVersion со значением 1 в разделе

HKCU\Control Panel\Desktop

Если у вас в свойствах панели задач установлено Группировать сходные кнопки панели задач, то Windows начинает группировать кнопки, если их число достигает 3 (по умолчанию). Вы можете изменить это число, используя параметр типа DWORD TaskbarGroupSize с вашим значением в разделе

HKCU\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\Advanced